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Titre
Adapt to snakemake 7.32.4 + comment CAT and deepMassed part because they don't actually work
!18
· créé
il y a 2 mois
par
Hugo LEFEUVRE
Fusionnées
mis à jour
il y a 2 mois
Update setup version
!17
· créé
il y a 3 mois
par
Hugo LEFEUVRE
Fusionnées
mis à jour
il y a 3 mois
DAS Tool can be used with genomes_collection part and remove some useless print and commented lines
!16
· créé
il y a 3 mois
par
Hugo LEFEUVRE
Fusionnées
mis à jour
il y a 3 mois
New binning strategie and tools and new bin refinement tool, new ARGs and MGEs detection tools
!15
· créé
il y a 3 mois
par
Hugo LEFEUVRE
New features
Fusionnées
mis à jour
il y a 3 mois
Create only classified taxo file
!14
· créé
il y a 7 mois
par
Hugo LEFEUVRE
New features
Fusionnées
mis à jour
il y a 7 mois
Add CDS option to search_orthology rule
!13
· créé
il y a 7 mois
par
Hugo LEFEUVRE
Bug
Fusionnées
mis à jour
il y a 7 mois
Large index and genes collection option + genes collection modification
!12
· créé
il y a 8 mois
par
Hugo LEFEUVRE
Fusionnées
mis à jour
il y a 8 mois
Change yml into yaml motus rule and remove img output fastqscreen
!11
· créé
il y a 10 mois
par
Hugo LEFEUVRE
Fusionnées
mis à jour
il y a 10 mois
delete illumina1_3 FQscreen parameter + add img output
!10
· créé
il y a 10 mois
par
Hugo LEFEUVRE
Bug
Fusionnées
mis à jour
il y a 10 mois
Slurm compatibility, tools version in yaml files and minor sripts modifications
!9
· créé
il y a 10 mois
par
Hugo LEFEUVRE
New features
Fusionnées
mis à jour
il y a 10 mois
Revert "Changes for Slurm config and smk version 7.32.4"
!8
· créé
il y a 11 mois
par
Hugo LEFEUVRE
debug_hugo
Fusionnées
mis à jour
il y a 11 mois
Modify GTDBtk version and Classify rules + add coverm calculation options
!7
· créé
il y a un an
par
Hugo LEFEUVRE
Bug
New features
Fusionnées
mis à jour
il y a un an
Rule coverage_statistics + add directory to path
!6
· créé
il y a un an
par
Hugo LEFEUVRE
Bug
Fusionnées
mis à jour
il y a un an
Add coverm, change eggnog command (genes_collection) and modify fastQ_screen DB download
!5
· créé
il y a un an
par
Hugo LEFEUVRE
Fusionnées
Approuvée
mis à jour
il y a un an
Change paths
!4
· créé
il y a un an
par
Hugo LEFEUVRE
Bug
Fusionnées
Approuvée
mis à jour
il y a un an
Debug MAGNETO
!3
· créé
il y a un an
par
Hugo LEFEUVRE
Bug
Fusionnées
mis à jour
il y a un an
modified README for better installation procedure, modified sge config for bird
!2
· créé
il y a un an
par
Eric CHARPENTIER
Fusionnées
mis à jour
il y a un an
Snakecore
!1
· créé
il y a 5 ans
par
Erwan DELAGE
Fusionnées
mis à jour
il y a 5 ans
