... | ... | @@ -33,7 +33,7 @@ Ce projet permet la visualisation d'alignements de graphes sous la forme d'un [h |
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/home/delage/Software/L-GRAAL-Software-package/L-GRAAL.exe -Q /home/delage/Data/IFREMER/Diff_interSouche/Diff_interSouche_2x.leda -T /home/delage/Data/IFREMER/Diff_interSouche/Diff_interSouche_WT.leda -q /home/delage/Data/IFREMER/Diff_interSouche/Diff_interSouche_2x.ndump2 -t /home/delage/Data/IFREMER/Diff_interSouche/Diff_interSouche_WT.ndump2 -B /home/delage/Data/IFREMER/Diff_interSouche/BLAST/BLAST.eval -o alpha0.2 -a 0.2
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Le graphe cible (**-T**) doit être le plus grand des deux. Il faut également que les graphes ne contiennent pas de "self-loop" qui génère une erreur à l'éxécution.
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Le graphe cible (**-T**) doit être le plus grand des deux (N.B. : celui avec le plus grand nombre d'arêtes). Il faut également que les graphes ne contiennent pas de "self-loop" qui génère une erreur à l'éxécution.
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Le paramètre **a** détermine la balance de poids entre la similarité topologique et de la similarité de séquences dans le calcul de l'alignement (i.e. a=0 -> similarité topologique seulement, a=1 -> similarité de séquences seulement)
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