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Jeffery PETIT / bnscore
GNU Affero General Public License v3.0Mis à jour -
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Theo LE CALVAR / marp-builder-docker
MIT LicenseMis à jour -
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Marko Budinich / atlanteconet
GNU General Public License v3.0 or laterAtlant-Eco Network Analysis repository
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Running matlab in a docker container.
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This pipeline aims to provide unsupervised data analysis from Singlecell RNAseq data. The alignment is done with Tophat2 followed by htseqcount. After filtering, DeSeq2 and Vst are applied. Finally, the unsupervised analysis is done with WGCNA.
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